More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1071 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1071  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  90.83 
 
 		 243 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  61.32 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 214 aa  241  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.31 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  47 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  47 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.59 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  41.78 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.92 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  40.18 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  38.94 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  39.07 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  40.83 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.64 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  38.36 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.64 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.45 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  39.07 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  38.36 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  38.36 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  38.36 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  39.07 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  38.36 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  39.07 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  39.07 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  42.13 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  42.4 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  39.07 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  41.12 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.91 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  40.76 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  39.09 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  42.13 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.56 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.35 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.77 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.87 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.56 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.68 
 
 		 196 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.14 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.38 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.28 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  36.62 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  38.65 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  38.81 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  39.64 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.75 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.34 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.27 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.97 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  35.89 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  35.89 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  36.6 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.44 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  41.2 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  36.87 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  37.04 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.45 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.34 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.19 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  35.78 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  40.34 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.5 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.44 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.07 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.92 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  38.79 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  35.47 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.49 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  38.94 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  36.82 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  38.94 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  33.96 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  38.94 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  38.94 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  36.73 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  34.45 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  36.36 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  37.5 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.35 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  34.03 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  36.79 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  35.71 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  32.13 
 
 		 249 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.49 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  36.82 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  33.47 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  37.04 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  36.32 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.9 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>