94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0756 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0756  methyltransferase type 11  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.055358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1562  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.940117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
246 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  30.69 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  29.51 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.81 
 
 
345 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  30.97 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  24.35 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  22.86 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  47.17 
 
 
206 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.8 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  34.95 
 
 
254 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  29.85 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
411 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
255 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
291 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.66 
 
 
296 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
634 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.88 
 
 
488 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  22.92 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2167  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
394 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1867  hypothetical protein  30.63 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  22.3 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  25.24 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.88 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
1739 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
184 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  22.7 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  30.86 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.68 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.03 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  25.74 
 
 
255 aa  42  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
274 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
346 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 
251 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 
251 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
226 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
643 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.3 
 
 
251 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  28.81 
 
 
261 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>