273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0765 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
213 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  97.18 
 
 
213 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  56.85 
 
 
198 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  47.18 
 
 
208 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  47.45 
 
 
204 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  49.49 
 
 
209 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  45.41 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  43.06 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  44.62 
 
 
204 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  46.7 
 
 
201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  44.72 
 
 
201 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  51.26 
 
 
207 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  42.08 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  47.21 
 
 
211 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  44.95 
 
 
200 aa  160  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  45.41 
 
 
212 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  43.37 
 
 
201 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  41.84 
 
 
198 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  42.35 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  37.76 
 
 
197 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  39.2 
 
 
200 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  40.65 
 
 
167 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  37.06 
 
 
204 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
200 aa  134  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  33 
 
 
200 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  31.47 
 
 
199 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  30.81 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  34.63 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  30.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  32.68 
 
 
217 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
149 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 
277 aa  88.2  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  37.97 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  27.5 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  37.58 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0410  hypothetical protein  67.69 
 
 
70 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.09 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.81 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.87 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  36.08 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  28.92 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  31.28 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.1 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  40.27 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  36.05 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.83 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  32.32 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  29.24 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
292 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
544 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  26.11 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  42.17 
 
 
243 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  36.6 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  33.77 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  33.83 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
675 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.94 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  38 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
271 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.02 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  26.11 
 
 
198 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  27.93 
 
 
291 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35.1 
 
 
410 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  27.5 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  25.4 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  36.52 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  46.55 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>