More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0403 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  99.53 
 
 		 428 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  847    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  74.53 
 
 		 428 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  97.66 
 
 		 428 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  75.06 
 
 		 438 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  72.66 
 
 		 428 aa  626  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  72.66 
 
 		 428 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  49.2 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  49.2 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 438 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  50.93 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  50.58 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  49.42 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  49.08 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  50.35 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  47.81 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  48.96 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  48.63 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  46.24 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  47.29 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  48.2 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  47.49 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  47.19 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  46.86 
 
 		 441 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  46.9 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  47.54 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 439 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 463 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.31 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 434 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 436 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 432 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 		 449 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  48.88 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 434 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.91 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 		 442 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 		 442 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  40.64 
 
 		 438 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.71 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>