More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03916 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03916  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  77.78 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  60.61 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  62.3 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  61.4 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  61.4 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  57.38 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  56.06 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  56.45 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  55.22 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  59.32 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  54.24 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  57.89 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  52.05 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  49.28 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  53.03 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  50.77 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  54.39 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  52.31 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  49.12 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  58.06 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  53.23 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  47.69 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  52.73 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  52.73 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  46.03 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  52.73 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  46.77 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  52.73 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  50.82 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  44.29 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  50.91 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  46.97 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  43.94 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  47.46 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  49.15 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  41.43 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  47.69 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  47.46 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  49.23 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  44.62 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  55.36 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  46.97 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  40.85 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>