280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1185 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  94.61 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  81.37 
 
 		 204 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  75.86 
 
 		 208 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  53.73 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  49.03 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  48.72 
 
 		 211 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  48.99 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  42.93 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  43.37 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  44.62 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  44.39 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  42.05 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  39.2 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  41.54 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  40.1 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  38.61 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  42.95 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  35.38 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  36.97 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.93 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.93 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  30.41 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  30.21 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  33.5 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  31 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  32.54 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  32.94 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.54 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  36.3 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.43 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  33.13 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.51 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.99 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.04 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.85 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  30 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  31.5 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  31.5 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  31.5 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  31.5 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 290 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  29.13 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  30.71 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  30.48 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  39.25 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  30.6 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  36.69 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.91 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  38.61 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  30.34 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  31.11 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  32.73 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  30.91 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.09 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  30.77 
 
 		 410 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 544 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>