More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4916 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  82 
 
 
403 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  77.42 
 
 
403 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  81.54 
 
 
403 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  82.84 
 
 
407 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
405 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  81.14 
 
 
403 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  80.45 
 
 
403 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.38 
 
 
397 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  62.28 
 
 
403 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.04 
 
 
397 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  61.85 
 
 
403 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  61.85 
 
 
403 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.35 
 
 
402 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.52 
 
 
396 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.32 
 
 
446 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  63.05 
 
 
399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.55 
 
 
396 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.01 
 
 
396 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.52 
 
 
396 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  60.71 
 
 
401 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  62.24 
 
 
399 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.47 
 
 
405 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.34 
 
 
400 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  61.92 
 
 
394 aa  484  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  59.84 
 
 
402 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  61.28 
 
 
399 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  61.26 
 
 
394 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  57.36 
 
 
401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  55.35 
 
 
390 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  54.62 
 
 
395 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  55.7 
 
 
396 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  55.12 
 
 
393 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  54.4 
 
 
401 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  54.5 
 
 
391 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  55.65 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  66.34 
 
 
313 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  53.87 
 
 
393 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  54.3 
 
 
393 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  52.36 
 
 
404 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  52.38 
 
 
397 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  52.63 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  52.23 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  51.85 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  53.87 
 
 
393 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  48.15 
 
 
391 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  49.2 
 
 
396 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.56 
 
 
399 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  48.14 
 
 
397 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.83 
 
 
397 aa  359  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
391 aa  359  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
391 aa  359  6e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  44.83 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.6 
 
 
396 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.56 
 
 
397 aa  352  7e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.7 
 
 
400 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
399 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.91 
 
 
399 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 
396 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  48.53 
 
 
398 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.18 
 
 
400 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  48.01 
 
 
399 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.33 
 
 
417 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  52.14 
 
 
388 aa  349  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.14 
 
 
388 aa  349  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.06 
 
 
404 aa  348  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  46.42 
 
 
394 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.04 
 
 
401 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.27 
 
 
402 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  44.91 
 
 
392 aa  347  2e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  48.04 
 
 
391 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.31 
 
 
405 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
395 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
405 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.31 
 
 
405 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.31 
 
 
405 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
395 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.31 
 
 
405 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.56 
 
 
405 aa  345  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.51 
 
 
396 aa  345  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.06 
 
 
405 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 
405 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 
405 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.8 
 
 
405 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.8 
 
 
405 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.8 
 
 
405 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0636462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.8 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 
405 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 
405 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  45.15 
 
 
386 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.1 
 
 
403 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.18 
 
 
406 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.83 
 
 
400 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3735  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.42 
 
 
406 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.18 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  45.18 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  45.18 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.18 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3641  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>