More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4243 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 290 aa  593  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  77.59 
 
 		 292 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  78.17 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  75.6 
 
 		 292 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  73.85 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  71.63 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  72.76 
 
 		 289 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  71.28 
 
 		 289 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  73.23 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  70.71 
 
 		 291 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  69.44 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  68.57 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  68.84 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  58.87 
 
 		 280 aa  346  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  58.52 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  59.77 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  58.65 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  58.52 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  57.35 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  55.75 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  55.78 
 
 		 278 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  53.38 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  47.78 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  49 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  48.36 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  43.49 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  44.28 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  45.99 
 
 		 275 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  44.98 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.4 
 
 		 414 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  42.97 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  42.47 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.8 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.41 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  42.32 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.49 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  43.36 
 
 		 267 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  42.59 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.59 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  42.59 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  41.86 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.84 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  40.39 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  40.23 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  41.86 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  41.44 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.08 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  34.25 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.31 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  39.85 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  39.85 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  39.48 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  40.22 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.34 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.31 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.98 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  39.55 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  38.15 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.45 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  36.54 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  39.62 
 
 		 277 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  39.83 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  39 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.75 
 
 		 280 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  38.83 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.74 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  36.5 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.98 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  37.02 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  43.08 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  42.69 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  35.48 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  37.45 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  37.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  41.15 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  34.48 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.21 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>