178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3015 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 329 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  90.88 
 
 		 329 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  89.67 
 
 		 329 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  79.82 
 
 		 330 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  70.95 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  58.54 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  57.19 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  55.83 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  50.33 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  46.41 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  44.03 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  42.91 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  42.18 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  40.61 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  41.45 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 		 337 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  38.82 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  38.96 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  38.82 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  38.82 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  38.82 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  36.01 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  36.27 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  34.54 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  33.91 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  33.91 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  32.87 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  32.55 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  33.56 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  32.87 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  32.87 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.87 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  32.53 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  33 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  34.02 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.56 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.04 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  32.28 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  33.11 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.77 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.49 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.16 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  33.57 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.24 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.41 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  33.12 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.91 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  30.13 
 
 		 429 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 429 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  30.13 
 
 		 429 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.57 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.67 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.33 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  35.34 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  29.08 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  31.46 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.46 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.08 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.84 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  31.27 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.23 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  28.18 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  26.54 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  28 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  32.31 
 
 		 484 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.13 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  28.31 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  27.18 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  27.18 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  25.93 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  27.51 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 777 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  26.52 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.33 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  25.87 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  27.36 
 
 		 491 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.13 
 
 		 485 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  26.35 
 
 		 479 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  26.35 
 
 		 479 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.24 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  25.78 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 791 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  25.31 
 
 		 481 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.26 
 
 		 438 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  28.1 
 
 		 381 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  24.47 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.26 
 
 		 438 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  27.97 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>