More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4507 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4436  hypothetical protein  45.07 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  39.13 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 327 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.12 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  40.36 
 
 		 191 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 		 191 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.84 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  41.3 
 
 		 311 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 322 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.82 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  39.26 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.21 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  38.36 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  42.24 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  36.54 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.11 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.33 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  32.03 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 		 311 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  36.48 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.46 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  36.25 
 
 		 313 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.77 
 
 		 186 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  40 
 
 		 306 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 		 304 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 		 330 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.42 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.78 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  35.33 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.92 
 
 		 311 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.95 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.57 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  34.16 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.65 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.06 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.95 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.96 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.93 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.73 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  33.95 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.75 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.85 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.1 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  34.59 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  37.96 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  35.46 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  37.96 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  32.47 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  35.15 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.7 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0442  putative flavin reductase  31.58 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.77 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>