248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3229 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  86.78 
 
 		 416 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 416 aa  806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  81.97 
 
 		 416 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  91.59 
 
 		 416 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  78.61 
 
 		 416 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  57.87 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  55.64 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  55.66 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  54.39 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  55.64 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  49.4 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  42.51 
 
 		 427 aa  338  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  43.78 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  43.78 
 
 		 421 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  40.83 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  37.41 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.85 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  38.1 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.35 
 
 		 412 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  34.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.36 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.74 
 
 		 475 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  35.12 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.33 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  34.88 
 
 		 408 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  33.49 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  35.28 
 
 		 585 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  35.99 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  35.61 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  35.66 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  35.55 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  34.11 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  35.05 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  36.5 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  33.9 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  34.24 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  33.66 
 
 		 402 aa  229  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  34.29 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.9 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  33.75 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  34.74 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  32.03 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  35.2 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  34.15 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  32.03 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.78 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  35.45 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  31.78 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  32.03 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  32.37 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  35.39 
 
 		 427 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  35.52 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  33.07 
 
 		 371 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  33.89 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  33.01 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.52 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  35.66 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  33.5 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  33.26 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  36.52 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  33.74 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  34.36 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  32.19 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  33.73 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  31.62 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  36.12 
 
 		 417 aa  217  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.66 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  34.89 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  32.43 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  33.1 
 
 		 420 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  32.79 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  33.02 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  33.82 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  33.58 
 
 		 401 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  32.55 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.35 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.76 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.25 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.17 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  34.59 
 
 		 419 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  32.94 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  28.78 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  32.79 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  32.79 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.25 
 
 		 566 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  32.08 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  34.83 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>