248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2998 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  78.45 
 
 		 412 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 413 aa  817    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53.19 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  49.76 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  49.03 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  45.05 
 
 		 409 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.06 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  44.68 
 
 		 418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  45.61 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.65 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  44.2 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  45.18 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  45.18 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  44.86 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  45.06 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  44.75 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  41.78 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  46.3 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  42.41 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  43.69 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  44.96 
 
 		 402 aa  312  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  43.69 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  39.66 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  42.51 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  45.77 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  41.18 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  43.58 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  43.1 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  42.55 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  41.13 
 
 		 422 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  42.93 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  43.56 
 
 		 585 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.65 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  40.9 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  39.95 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  43.93 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  43.93 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  43.93 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  42.45 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  43.93 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  43.93 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  42.62 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  42.45 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  43.06 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  42.11 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  42.72 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  43.2 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  42.22 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  43.24 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  42.29 
 
 		 420 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  42.96 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  39.17 
 
 		 403 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  43.69 
 
 		 403 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  44.11 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  42.42 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  42.52 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  43.1 
 
 		 566 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  41.39 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.82 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  38.65 
 
 		 406 aa  292  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  40.74 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  42.22 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.92 
 
 		 475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  42.39 
 
 		 419 aa  289  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  42.12 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  42.86 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  42.86 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  40.49 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  42.62 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  42.15 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  41.65 
 
 		 408 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  43.09 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  40.91 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  40.83 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  42.86 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  42.86 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  41.69 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.79 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.29 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  42.29 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  42.29 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  41.45 
 
 		 419 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  41.13 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.41 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  38.69 
 
 		 402 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  43.13 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  43.13 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.44 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  38.44 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  38.73 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  43.13 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  41.69 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  38.44 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  38.05 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  39.62 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  41.31 
 
 		 425 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  40.85 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  39.95 
 
 		 443 aa  268  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  41.12 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  39.06 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>