248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2908 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 419 aa  812    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  69.54 
 
 		 418 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  68.42 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  52.26 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  53.08 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  48.16 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  48.33 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  48.83 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  49.88 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  49.06 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  46.67 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  48.01 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  49.04 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  49.14 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  48.55 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  46.5 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  48.55 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  49.28 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  49.29 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  50.12 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  50.12 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  50.12 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  46.01 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  47.32 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  47.43 
 
 		 419 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  46.03 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  48.55 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.55 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  48.55 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  48.79 
 
 		 402 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  47.92 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  44.95 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  48.07 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  47.79 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  47.79 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  47.66 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  47.43 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  46.62 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  49.3 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  45.91 
 
 		 406 aa  359  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  46.86 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  46.96 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  47.2 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  47.43 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  45.25 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  47.2 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  45.67 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  46.08 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  46.96 
 
 		 419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  49.06 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  44.88 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  46.62 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  48.83 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.33 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  46.08 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  48.33 
 
 		 416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  44.34 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  44.71 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.28 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  44.88 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.39 
 
 		 413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  45.07 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  44.78 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.48 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.48 
 
 		 566 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  45.24 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  45.24 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  45.01 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  45.01 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  44.2 
 
 		 408 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  46.91 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  43.72 
 
 		 408 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  43.53 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  44.36 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  42 
 
 		 424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.69 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  43.61 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  42.75 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.75 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  42.75 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.6 
 
 		 416 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  43.13 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  43.13 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  39.86 
 
 		 416 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  43 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  43.39 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.55 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  40.09 
 
 		 416 aa  302  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  42.79 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  40.09 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  40.09 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  40.09 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  39.86 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  37.41 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  39.86 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  39.86 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  43.46 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  39.62 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  43.1 
 
 		 418 aa  292  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  39.39 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>