248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4717 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 420 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.03 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53.19 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  43.81 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  43.33 
 
 		 408 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  44.16 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.51 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.16 
 
 		 432 aa  296  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.28 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  43.16 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  38.33 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  38 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  38.99 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  38.16 
 
 		 402 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  40.51 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  38 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  39.52 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  38.22 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  40.64 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.32 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  39.86 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  38.86 
 
 		 402 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  39.95 
 
 		 414 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  36.14 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  37.97 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  37.05 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  38.26 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  38.48 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  38.3 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  38.3 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  38.3 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  38.3 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  38.3 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  37.69 
 
 		 585 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  38.06 
 
 		 403 aa  255  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  36.64 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  37.84 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  36.74 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  37.83 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  34.78 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  36.51 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  39.07 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  39.07 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  39.07 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  36.03 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.19 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  38.46 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  35.75 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  37.01 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  36.03 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  37.41 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  35.19 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  35.92 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  36.49 
 
 		 419 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  36.57 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  36.87 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  38.55 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  36.18 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  38.33 
 
 		 408 aa  249  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  36.64 
 
 		 419 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  35.9 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  36.18 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  36.18 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  36.92 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  37.44 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  36.26 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  36.26 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  37.2 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  34.98 
 
 		 432 aa  246  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  37.5 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  37.86 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  35.05 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  36.18 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  38.02 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  36.41 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  36.21 
 
 		 420 aa  242  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  35.66 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  35.42 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.42 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  35.42 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  34.35 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  36.15 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  36.28 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  34.87 
 
 		 401 aa  236  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  34.26 
 
 		 424 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  38.5 
 
 		 425 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.53 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  34.26 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  34.26 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  34.26 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  34.27 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  34.41 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  33.57 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  36.9 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  34.8 
 
 		 424 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  34.8 
 
 		 424 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  34.8 
 
 		 424 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  35.32 
 
 		 427 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  32.86 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  34.89 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>