248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0109 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  100 
 
 
424 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  99.76 
 
 
424 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  76.18 
 
 
424 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  97.41 
 
 
426 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  100 
 
 
424 aa  822    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  99.76 
 
 
424 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  99.53 
 
 
566 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  99.76 
 
 
424 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  75.24 
 
 
424 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  75.24 
 
 
424 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  75.24 
 
 
424 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  68.48 
 
 
425 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  68.01 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  57.14 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  58.12 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  56.66 
 
 
416 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  56.66 
 
 
416 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  54.8 
 
 
420 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  57.41 
 
 
427 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  57.18 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  55.42 
 
 
416 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  57.21 
 
 
416 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  57.92 
 
 
423 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  57.68 
 
 
423 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  55.16 
 
 
419 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  57.38 
 
 
414 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  54.8 
 
 
420 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  57.92 
 
 
423 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  54.46 
 
 
419 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  55.19 
 
 
416 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  55.19 
 
 
416 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  55.19 
 
 
416 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  54.93 
 
 
419 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  54.95 
 
 
416 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  54.95 
 
 
416 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  54.95 
 
 
416 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  56.37 
 
 
418 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  54.48 
 
 
416 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  54.9 
 
 
432 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  52.59 
 
 
422 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  54.48 
 
 
416 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  54.48 
 
 
416 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  54.48 
 
 
416 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  54.25 
 
 
416 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  54.93 
 
 
419 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  55.79 
 
 
419 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  55.34 
 
 
413 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  55.63 
 
 
419 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  55.4 
 
 
419 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  55.4 
 
 
419 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  55.4 
 
 
419 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  52.12 
 
 
422 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  55.63 
 
 
419 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  55.16 
 
 
420 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  54.93 
 
 
419 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  52.57 
 
 
420 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  54.93 
 
 
419 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  54.01 
 
 
416 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  56.22 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  54.01 
 
 
416 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  55.16 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  57.41 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  54.01 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  51.89 
 
 
422 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  52.25 
 
 
414 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  54.72 
 
 
416 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  56.47 
 
 
425 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  52 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  55.37 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  55.97 
 
 
416 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  51.44 
 
 
402 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  50.24 
 
 
403 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  47.52 
 
 
402 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  49.53 
 
 
417 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  48.58 
 
 
404 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  48.82 
 
 
403 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  49.65 
 
 
402 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  48.35 
 
 
402 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  48.91 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  45.43 
 
 
406 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  45.95 
 
 
399 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  46.08 
 
 
402 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  45.41 
 
 
402 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  45.84 
 
 
402 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  44.66 
 
 
405 aa  345  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  45.84 
 
 
402 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.84 
 
 
402 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  45.24 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  44.42 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  46.82 
 
 
408 aa  335  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  44.31 
 
 
401 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  42.32 
 
 
406 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  43.57 
 
 
401 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  46.27 
 
 
371 aa  328  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  44.89 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  42.86 
 
 
403 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  42.96 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  42.72 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  42.99 
 
 
403 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  42.08 
 
 
408 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>