248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0394 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 
440 aa  859    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.3 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  54.98 
 
 
432 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  51.74 
 
 
408 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.8 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  51.28 
 
 
408 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.78 
 
 
475 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  47.63 
 
 
585 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.73 
 
 
412 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  47.96 
 
 
420 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  49.29 
 
 
419 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  50.12 
 
 
403 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  49.42 
 
 
402 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.32 
 
 
459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  48.77 
 
 
418 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  47.79 
 
 
427 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.06 
 
 
413 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  47.03 
 
 
417 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  47.48 
 
 
414 aa  349  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  46.3 
 
 
403 aa  349  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  47.35 
 
 
427 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  46.3 
 
 
443 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  46.68 
 
 
427 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  46.74 
 
 
402 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  45.73 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  48.76 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  45.08 
 
 
402 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  45.29 
 
 
405 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  45.73 
 
 
403 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  45.64 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  43.81 
 
 
422 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  45.27 
 
 
403 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  45.95 
 
 
420 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  44.7 
 
 
399 aa  332  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  45.95 
 
 
420 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  43.02 
 
 
402 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  46.09 
 
 
419 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  46.09 
 
 
419 aa  329  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.35 
 
 
406 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  46.35 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  45.64 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  45.64 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  45.64 
 
 
419 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  43.39 
 
 
404 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  44.97 
 
 
419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  42.44 
 
 
422 aa  326  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  44.77 
 
 
419 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  45.64 
 
 
419 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  44.88 
 
 
401 aa  323  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  45.39 
 
 
419 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  44.35 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  45.96 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  45.96 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  45.96 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  45.96 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  42.76 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  45.96 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  46.74 
 
 
423 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  46.74 
 
 
423 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  45.33 
 
 
425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  45.73 
 
 
403 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  45.5 
 
 
403 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  46.22 
 
 
423 aa  319  7.999999999999999e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  45.19 
 
 
419 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  45.19 
 
 
419 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  46.28 
 
 
414 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  45.19 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  46.29 
 
 
425 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.33 
 
 
420 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  45.25 
 
 
371 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  41.84 
 
 
402 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  41.06 
 
 
402 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  47.19 
 
 
425 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  42 
 
 
422 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  40.7 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.67 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  44.25 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  41.84 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  43.4 
 
 
425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  41.84 
 
 
402 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.84 
 
 
402 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  41.84 
 
 
402 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  41.01 
 
 
403 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  42.17 
 
 
401 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  41.29 
 
 
419 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  40.88 
 
 
566 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  39.91 
 
 
416 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  41.24 
 
 
424 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  42.92 
 
 
408 aa  292  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  40.59 
 
 
416 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  40.62 
 
 
426 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  40.59 
 
 
416 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  41.02 
 
 
424 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  40.59 
 
 
416 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  41.02 
 
 
424 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  41.1 
 
 
417 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  40.8 
 
 
424 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  40 
 
 
416 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  40 
 
 
416 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.82 
 
 
416 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>