248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1193 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 475 aa  947    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  67.74 
 
 		 585 aa  604  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.78 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  50.57 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  49.17 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  49.41 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  48.58 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.23 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.95 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.92 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  41.12 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  41.92 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  42.56 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  41.16 
 
 		 420 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  41.74 
 
 		 422 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  40.73 
 
 		 422 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  41.51 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  40.57 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  40.57 
 
 		 403 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  40.57 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  41.25 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  40.19 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  41.23 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  39.54 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  40.24 
 
 		 402 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  39.91 
 
 		 422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  40.33 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  40.92 
 
 		 427 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  40.28 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  40.8 
 
 		 402 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  38.99 
 
 		 420 aa  279  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  41.23 
 
 		 402 aa  279  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  40.23 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  39.86 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  41.19 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  36.6 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  40.09 
 
 		 425 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  40.14 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  39.54 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  39.68 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  38.94 
 
 		 418 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  38.86 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  40.88 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.05 
 
 		 420 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  39.29 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  39.71 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  40.33 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  39.44 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  39.44 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  39.68 
 
 		 419 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  40.23 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  39.68 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  38.59 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  38.76 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  39.44 
 
 		 419 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.34 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  39.64 
 
 		 432 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  38.62 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  38.62 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  38.62 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  37.91 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  36.3 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  37.82 
 
 		 419 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  38.44 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  38.65 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  36.56 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  39.86 
 
 		 423 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  39.86 
 
 		 423 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.59 
 
 		 566 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  39.64 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  36.7 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  36.7 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  38.32 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  36.7 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.59 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.28 
 
 		 416 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  36.74 
 
 		 416 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  36.47 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  35.67 
 
 		 419 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  36.47 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  36.57 
 
 		 417 aa  253  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  36.38 
 
 		 416 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  36.02 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  38.29 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  36.02 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.12 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  38.95 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  38.68 
 
 		 371 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  34.03 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  36.21 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.53 
 
 		 416 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.98 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  35.98 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  35.98 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>