248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2232 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  86.78 
 
 		 416 aa  707    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  91.59 
 
 		 416 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  81.25 
 
 		 416 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  100 
 
 		 416 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  76.92 
 
 		 416 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  57.38 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  54.94 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.63 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  54.39 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  54.64 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  50.6 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  41.79 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  44.5 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  43.3 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  40.2 
 
 		 419 aa  302  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.26 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  37.65 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  36.96 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.82 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  38.78 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.26 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.81 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  33.73 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.38 
 
 		 475 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  34.63 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  34.39 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  35.55 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  35.05 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  34.35 
 
 		 427 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 420 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  35.28 
 
 		 585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  35.92 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  34.92 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.73 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  34.62 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  34.62 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  33.01 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  33.5 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  33.01 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  33.01 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.01 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  34.19 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  35.37 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  32.61 
 
 		 401 aa  227  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  34.43 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  33.81 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  33.5 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.49 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  36.34 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  33.66 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  34.27 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  32.28 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  35.6 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  31.71 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  34.79 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  34.44 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  32.93 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  34 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  35.37 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  33.96 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  34.19 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  34.68 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.7 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  36.45 
 
 		 416 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  33.96 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  32.35 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  33.96 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  33.96 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.84 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  34.29 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  32.09 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  30.14 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  33.73 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  34.06 
 
 		 401 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  32.52 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  32.52 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.57 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  32.68 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  32.03 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  34.67 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  32.27 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  34.67 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.73 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  30.68 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.76 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  34.43 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  35.56 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  31.82 
 
 		 432 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  33.18 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  31.46 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  34.43 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>