248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0307 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 419 aa  808    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  44.15 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.44 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  45.08 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.14 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  41.91 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  41.12 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  40.83 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  41.5 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  40.2 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  44.44 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  42.45 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.92 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  36.39 
 
 		 427 aa  279  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  41.59 
 
 		 421 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  39.66 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  35.66 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  34.94 
 
 		 408 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  33.72 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.86 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.13 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  31.96 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  33.41 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  35.6 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  31.04 
 
 		 414 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  33.73 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  35.25 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  33.87 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  30.95 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  32.46 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.61 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  34.69 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  34.6 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  34.6 
 
 		 416 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  34.36 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  32.2 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  33.18 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  32.74 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  31.93 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  34.36 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  33.64 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  33.18 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.85 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  34.36 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  30.35 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  34.36 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  32.11 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  32.11 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.11 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  32.11 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  32.45 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  32.61 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.64 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  33.5 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.64 
 
 		 566 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  32.45 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  33.73 
 
 		 416 aa  196  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  34.36 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  33.49 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  34.56 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  32.67 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  33.25 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  31.65 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  33.18 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  31.47 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  33.25 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  32.56 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  32.68 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  32.68 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  32.68 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  30.71 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  31.61 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  31.88 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  31.31 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  33.64 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  33.26 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  30.19 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  33.73 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  31.64 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  31.71 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  32.71 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  31.71 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  31.71 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  31.71 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  31.71 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  31.71 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  31.71 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  32.13 
 
 		 402 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  31.4 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  31.78 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  32.56 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  32.85 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>