248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02093 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  87.98 
 
 		 416 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  100 
 
 		 416 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  99.76 
 
 		 416 aa  806    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  87.98 
 
 		 416 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  99.76 
 
 		 416 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  87.74 
 
 		 415 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  99.76 
 
 		 416 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  88.7 
 
 		 416 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  87.98 
 
 		 416 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  99.04 
 
 		 416 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  88.22 
 
 		 416 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  99.52 
 
 		 416 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  88.46 
 
 		 416 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  87.98 
 
 		 416 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  98.08 
 
 		 416 aa  795    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  810    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  57.01 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  57.24 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  54.95 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  54.95 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  54.95 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  54.95 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  54.01 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  54.72 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  54.72 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  53.9 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  54.37 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  54.37 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  54.37 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.31 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  47.52 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  49.65 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.74 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  49.29 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  52.74 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  49.29 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  52.24 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  51.76 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.16 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  47.42 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  51.44 
 
 		 419 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  50.89 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  49.18 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  49.18 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  49.88 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  48.36 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50.72 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  49.27 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  49.27 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  48.83 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  49.53 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  49.53 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  49.3 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  49.53 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  49.06 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  48.94 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  49.88 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  46.97 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  48.83 
 
 		 419 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  48.7 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  48.7 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  49.06 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  49.06 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  46.99 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  46.17 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  49.88 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  45.91 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  45.69 
 
 		 417 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  48.59 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  50.12 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  47.15 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  48.36 
 
 		 419 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  44.71 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  48.1 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  44.1 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  43.93 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.03 
 
 		 406 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  44.39 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  46.04 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  44.17 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  40.48 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  45.08 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  42.07 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  42.17 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  40.68 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  41.4 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  42.58 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  39.15 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  40.68 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  40.68 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.68 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  42.44 
 
 		 403 aa  315  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  42.86 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  41.95 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  43.17 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  43.41 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  43.27 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  41.61 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  40.53 
 
 		 401 aa  305  8.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  41 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>