248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5501 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 
416 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  86.78 
 
 
416 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  76.33 
 
 
416 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  77.54 
 
 
416 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  76.09 
 
 
416 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  78.26 
 
 
415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  61.31 
 
 
413 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  56.32 
 
 
425 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  55.9 
 
 
425 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  55.37 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  55.37 
 
 
424 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  55.13 
 
 
424 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  55.13 
 
 
426 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  55.37 
 
 
424 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  55.37 
 
 
566 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  54.07 
 
 
424 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  55.13 
 
 
424 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  53.5 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  53.5 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  53.5 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  50.85 
 
 
427 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  49.52 
 
 
420 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  51.58 
 
 
427 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  51.69 
 
 
427 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  48.21 
 
 
422 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  48.69 
 
 
422 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  49.76 
 
 
425 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  47.46 
 
 
416 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  47.7 
 
 
416 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  47.7 
 
 
416 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  47.7 
 
 
416 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  47.7 
 
 
416 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  47.46 
 
 
416 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  50.72 
 
 
423 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  50.72 
 
 
423 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  50.72 
 
 
423 aa  358  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  48.21 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  47.94 
 
 
415 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50.49 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  47.22 
 
 
416 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  47.22 
 
 
416 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  47.22 
 
 
416 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  47.22 
 
 
416 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  47.22 
 
 
416 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  46.97 
 
 
416 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  47.98 
 
 
419 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  46.97 
 
 
416 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  46.97 
 
 
416 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  50.62 
 
 
414 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  47.22 
 
 
416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  46.34 
 
 
419 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  47.16 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  47.88 
 
 
408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  46.12 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  46.81 
 
 
419 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  46.57 
 
 
419 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  46.81 
 
 
419 aa  335  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  46.81 
 
 
419 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  47.28 
 
 
419 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  47.28 
 
 
419 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  48.7 
 
 
425 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  47.52 
 
 
419 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  46.57 
 
 
419 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  46.45 
 
 
419 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  46.1 
 
 
419 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  46.57 
 
 
419 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  48.94 
 
 
425 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  47.43 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  46.19 
 
 
402 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  45.45 
 
 
406 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  44.5 
 
 
432 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  44.6 
 
 
419 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  45.41 
 
 
420 aa  322  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  45.85 
 
 
420 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  45.32 
 
 
403 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  44.74 
 
 
399 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  44.81 
 
 
418 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  46.27 
 
 
417 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  44.15 
 
 
405 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  43.15 
 
 
402 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  44.67 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  44.42 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.42 
 
 
402 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  43.72 
 
 
403 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  44.01 
 
 
404 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  43.55 
 
 
402 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  44.42 
 
 
402 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  43.72 
 
 
403 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  43.97 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  42.93 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  43.66 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  43.91 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  44.77 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  42.68 
 
 
408 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  44.81 
 
 
402 aa  302  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  42.96 
 
 
403 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  43.92 
 
 
371 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  43.35 
 
 
401 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  40.98 
 
 
401 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  43.89 
 
 
401 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>