248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2505 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  97.55 
 
 
408 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  100 
 
 
408 aa  792    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.64 
 
 
412 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  49.4 
 
 
417 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.03 
 
 
413 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  49.41 
 
 
427 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  52.87 
 
 
432 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50.12 
 
 
418 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  50.35 
 
 
427 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.43 
 
 
432 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  46.41 
 
 
420 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.28 
 
 
440 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  49.17 
 
 
427 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  47.91 
 
 
402 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  47.86 
 
 
420 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  47.88 
 
 
404 aa  363  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50 
 
 
409 aa  362  6e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  47.17 
 
 
403 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  48.56 
 
 
419 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  47.49 
 
 
419 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  47.51 
 
 
402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  48.9 
 
 
414 aa  355  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.58 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  49.29 
 
 
425 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  50.76 
 
 
408 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  45.37 
 
 
406 aa  352  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  46.9 
 
 
420 aa  352  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  44.94 
 
 
422 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  46.94 
 
 
403 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  46.71 
 
 
585 aa  351  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  46.68 
 
 
403 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  44.76 
 
 
418 aa  349  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  46.68 
 
 
403 aa  348  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  48.45 
 
 
419 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  48.45 
 
 
419 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  46.17 
 
 
402 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  43.97 
 
 
422 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  47.97 
 
 
419 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  47.73 
 
 
419 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  48.09 
 
 
419 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  47.73 
 
 
419 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  47.06 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  47.51 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  48.45 
 
 
419 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  45.93 
 
 
399 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  48.21 
 
 
419 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  47.49 
 
 
419 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  45.71 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  47.95 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  46.06 
 
 
432 aa  339  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  47.77 
 
 
402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  45.02 
 
 
402 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.02 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  45.02 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  43.84 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  45.6 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.79 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  44.78 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  47.97 
 
 
419 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  47.97 
 
 
419 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  45.89 
 
 
401 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  47.97 
 
 
419 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  48.33 
 
 
423 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  48.33 
 
 
423 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  48.1 
 
 
423 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  44.12 
 
 
425 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  45.52 
 
 
424 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  45.52 
 
 
424 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  45.52 
 
 
424 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  45.07 
 
 
422 aa  332  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  43.72 
 
 
419 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  46.06 
 
 
416 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  47.19 
 
 
403 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  47.19 
 
 
403 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  47.19 
 
 
403 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  47.19 
 
 
403 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  47.19 
 
 
403 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  46.06 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  46.7 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  47.19 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  45.61 
 
 
408 aa  329  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  43.87 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  46.93 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.66 
 
 
416 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  43.41 
 
 
425 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  44.61 
 
 
402 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  46.59 
 
 
425 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  46.06 
 
 
403 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  46.52 
 
 
371 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  41.03 
 
 
406 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  42.82 
 
 
417 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.03 
 
 
418 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.3 
 
 
413 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  42.08 
 
 
424 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  42.08 
 
 
424 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  42.32 
 
 
426 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  42.08 
 
 
424 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  42.64 
 
 
401 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  42.08 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  41.84 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>