248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1098 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  84.58 
 
 
402 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  78.11 
 
 
404 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  100 
 
 
402 aa  784    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  69.65 
 
 
403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  68.16 
 
 
402 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  68.41 
 
 
402 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  55.42 
 
 
406 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  56.48 
 
 
414 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  53.14 
 
 
417 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  51.9 
 
 
420 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  53.22 
 
 
419 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  53.1 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  56.61 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  52.38 
 
 
420 aa  411  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  52.51 
 
 
419 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  53.38 
 
 
399 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  52.98 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  53.37 
 
 
419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  52.51 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  52.27 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  52.51 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  48.46 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  50.93 
 
 
432 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  49.05 
 
 
422 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  52.27 
 
 
419 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  52.27 
 
 
419 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  52.98 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  53.75 
 
 
401 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  52.27 
 
 
419 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  52.27 
 
 
419 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  55.61 
 
 
371 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  51.99 
 
 
402 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  48.95 
 
 
427 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  51.99 
 
 
402 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  51.45 
 
 
414 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.99 
 
 
402 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  52.88 
 
 
402 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  51.57 
 
 
419 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  53.38 
 
 
403 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  48.69 
 
 
422 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  51.79 
 
 
419 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  51.74 
 
 
402 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  51.87 
 
 
401 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  48.94 
 
 
425 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50.72 
 
 
418 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  50 
 
 
427 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  49.76 
 
 
427 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  51.64 
 
 
425 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  50.49 
 
 
408 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  50.12 
 
 
423 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  47.53 
 
 
425 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  48.01 
 
 
403 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  50.12 
 
 
423 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  50.12 
 
 
423 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  47.74 
 
 
425 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  46.84 
 
 
424 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  48.97 
 
 
408 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  46.27 
 
 
420 aa  362  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  45.07 
 
 
406 aa  362  9e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  46.77 
 
 
403 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  47.02 
 
 
418 aa  358  6e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  49.53 
 
 
425 aa  358  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  46.86 
 
 
419 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  47.51 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  47.51 
 
 
408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  46.9 
 
 
403 aa  356  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  46.27 
 
 
403 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  47.33 
 
 
417 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  46.93 
 
 
424 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  46.93 
 
 
424 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  46.93 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.09 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  50 
 
 
408 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  45.65 
 
 
424 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  47.03 
 
 
416 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  45.5 
 
 
415 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  45.41 
 
 
424 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.03 
 
 
416 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  45.41 
 
 
424 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.41 
 
 
424 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  47.15 
 
 
403 aa  345  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.39 
 
 
566 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  46.9 
 
 
403 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  44.92 
 
 
426 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  45.18 
 
 
424 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.33 
 
 
416 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  45.36 
 
 
401 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  44.15 
 
 
416 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  45.45 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  45.59 
 
 
399 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  44.39 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  44.39 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  44.39 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  44.39 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  44.39 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>