248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1541 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  82.79 
 
 
399 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  100 
 
 
405 aa  786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  78.91 
 
 
401 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  76.49 
 
 
402 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  76.49 
 
 
402 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  76.49 
 
 
402 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  76.24 
 
 
402 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  74.06 
 
 
401 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  77.75 
 
 
371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  58.96 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  56.76 
 
 
420 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  57.36 
 
 
404 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  56.4 
 
 
427 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  54.98 
 
 
420 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  56.07 
 
 
414 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  53.59 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  55.81 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  54.2 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  56.61 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  54.98 
 
 
402 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  55.09 
 
 
402 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  55.22 
 
 
402 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  55.24 
 
 
427 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  55.48 
 
 
427 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  54.92 
 
 
419 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  50.5 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  50.83 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  55.21 
 
 
425 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  53.98 
 
 
403 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  53.25 
 
 
403 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  54.48 
 
 
402 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  51.96 
 
 
417 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  54.2 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  54.48 
 
 
419 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  53 
 
 
419 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  56.13 
 
 
414 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  52.76 
 
 
419 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  52.52 
 
 
419 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  52.76 
 
 
419 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  50.12 
 
 
422 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  50.93 
 
 
432 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  53.48 
 
 
419 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  53.48 
 
 
419 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  52.76 
 
 
419 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  54.61 
 
 
408 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  52.04 
 
 
419 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  51.55 
 
 
418 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  52.04 
 
 
419 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  53.79 
 
 
419 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  56.16 
 
 
423 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  56.16 
 
 
423 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  55.69 
 
 
423 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  49.64 
 
 
422 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  50.12 
 
 
420 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  51.91 
 
 
408 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  46.93 
 
 
425 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  55.21 
 
 
425 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  55.21 
 
 
425 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  47.17 
 
 
425 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  48.07 
 
 
419 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  47.52 
 
 
403 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  53.48 
 
 
408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  48.02 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  47.15 
 
 
403 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  50.25 
 
 
417 aa  358  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  47.39 
 
 
403 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  44.66 
 
 
426 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  44.66 
 
 
424 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  44.66 
 
 
424 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  44.66 
 
 
424 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  44.66 
 
 
424 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  44.66 
 
 
566 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  44.66 
 
 
424 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  46.88 
 
 
416 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  47.51 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  44.89 
 
 
424 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  47.26 
 
 
408 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  46.38 
 
 
416 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.1 
 
 
413 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  49.12 
 
 
401 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  45.16 
 
 
424 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  45.16 
 
 
424 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  45.16 
 
 
424 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.94 
 
 
416 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  49.74 
 
 
401 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  45.82 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  47.28 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  47.03 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  47.03 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  47.03 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  47.03 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  47.03 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  47.03 
 
 
403 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.29 
 
 
440 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  45.29 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  44.33 
 
 
399 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.15 
 
 
416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.3 
 
 
412 aa  308  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  41.65 
 
 
416 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  42.89 
 
 
418 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>