248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1487 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  86.57 
 
 		 402 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  89.8 
 
 		 402 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  100 
 
 		 403 aa  785    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  73.45 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  72.89 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  69.65 
 
 		 402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  54.32 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  52.49 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  54.46 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  55.94 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  53.33 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  55.07 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  53.46 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  52.98 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  53.24 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  53.33 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  52.27 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  53.46 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  53.22 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  52.98 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  53.22 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  53.94 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  52.93 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  52.61 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  52.27 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  52.94 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  51.85 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  47.87 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  52.72 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  52.51 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  52.36 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.36 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  52.27 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  52.25 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  53 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  52.62 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  53.25 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  52.99 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  51.76 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  46.92 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  54.3 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  52.24 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  51.06 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  50.99 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  53.66 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  53.66 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  53.66 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  46.68 
 
 		 422 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  51.2 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  49.75 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  51.64 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  52.03 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  48.67 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  54.16 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  53.32 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  47.95 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  48.82 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  48.58 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  48.35 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  48.82 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  48.82 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  48.58 
 
 		 566 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  50 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  47.52 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  48.58 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  50 
 
 		 401 aa  362  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  48.02 
 
 		 403 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  44.94 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  45.67 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  48.44 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  46.3 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  46.78 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  50 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  48.39 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  48.39 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  48.39 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  46.53 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  45.79 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  48.18 
 
 		 415 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  46.73 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  47.42 
 
 		 408 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  47.06 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  45.57 
 
 		 416 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.57 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  45.79 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  45.54 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.94 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.04 
 
 		 413 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  42.79 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  42.79 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  42.55 
 
 		 416 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  42.07 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  42.55 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  42.55 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  42.27 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>