248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0875 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 443 aa  870    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.7 
 
 		 411 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  53.73 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  50.96 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.6 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  56.78 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.6 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  49.4 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  49.52 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  53.7 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  50.71 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.5 
 
 		 417 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  41.5 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  44.58 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  43.41 
 
 		 421 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  39.61 
 
 		 427 aa  299  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  37.29 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  37.29 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.45 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  36.3 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  35.01 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  35.58 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  35.89 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.21 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  34.38 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  34.94 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  35.5 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.13 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  33.65 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  33.74 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  34.22 
 
 		 402 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.22 
 
 		 402 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  34.47 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.48 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.29 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  34.22 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  33.74 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  33.81 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  32.78 
 
 		 416 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  34.89 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  33.18 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  32.39 
 
 		 416 aa  223  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  32.39 
 
 		 416 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  32.39 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  32.39 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  34.2 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  33.89 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  32.39 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  33.41 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  33.02 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  34.52 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.63 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  34.48 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  32.78 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  32.39 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  32.39 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.96 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  32.23 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  34.21 
 
 		 399 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  32.55 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  34.15 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  32.55 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  35.42 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  32.21 
 
 		 403 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.56 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  32.69 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  34.83 
 
 		 418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  32.21 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 432 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  32.05 
 
 		 403 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  32.02 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  32.94 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  33.02 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  34.81 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  35.12 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  33.89 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.88 
 
 		 416 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  32.89 
 
 		 585 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  34.22 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  32.93 
 
 		 408 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  34.22 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  34.22 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  31.73 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  32.87 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  31.73 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  31.12 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  32.56 
 
 		 419 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  33.49 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  31.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  31.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  31.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  31.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  31.49 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  32.02 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>