248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3336 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 427 aa  845    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.51 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  42.51 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  43.47 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.51 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.11 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  41.79 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  40.58 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  43.23 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  44.12 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  44.86 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  43.13 
 
 		 420 aa  325  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  41.3 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.14 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  39.61 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  36.39 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  35.04 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  35.35 
 
 		 408 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  35.35 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  35.99 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  36.16 
 
 		 419 aa  242  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  35.71 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  34.71 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  35.73 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  35.63 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.19 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  37.93 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  35.77 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  33.5 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  34.52 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  32.84 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.84 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  34.34 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  34.52 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  33.5 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.7 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  34.29 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  34.29 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  34.29 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  35.65 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  34.31 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.13 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  35.73 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  34.2 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  35.1 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.48 
 
 		 420 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  34.52 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  32.35 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  33.58 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  34.05 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  33.73 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  34.05 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  33.72 
 
 		 420 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  34.54 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  35.39 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  32.29 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  33.58 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  34.58 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  33.81 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  34.2 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  36.56 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  32.08 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  34.12 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.72 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  34.06 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.3 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  34.76 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  33.82 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  33.26 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.8 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  34.09 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  33.81 
 
 		 416 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  33.65 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  31.55 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  33.73 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  33.57 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  33.57 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  34.68 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 426 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  35.49 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  32.55 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  33.02 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  32.78 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  33.33 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  33.33 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  32.02 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>