248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2461 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  86.78 
 
 		 416 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  83.17 
 
 		 416 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  86.78 
 
 		 416 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 416 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  78.85 
 
 		 416 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  59.08 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.89 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  54.63 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  56.97 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  53.73 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.11 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  50.96 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  42.51 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  43.65 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  42.79 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  43.14 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  38.69 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  37.68 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  36.28 
 
 		 585 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  37.56 
 
 		 422 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.98 
 
 		 432 aa  245  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  36.23 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  36.08 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  34.46 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.28 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  36.6 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  36.82 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  35.12 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.95 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  33.49 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  33.5 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  33.5 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  33.5 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.5 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  35.34 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  35.34 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  33.41 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  35.21 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  35.18 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.19 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  34.63 
 
 		 408 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  34.64 
 
 		 404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  35.86 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  35.55 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  34.79 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  35.12 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  34.39 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  35.21 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  37.47 
 
 		 414 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  35.54 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  35.48 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.14 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  32.61 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  35.54 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  34.74 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  33.82 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  32.6 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  34.98 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  33.25 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  35.54 
 
 		 408 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  33.09 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  34.98 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  34.98 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  34.98 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  33.99 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  36.07 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  35.21 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  34.51 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.71 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  34.98 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  36.71 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  34.74 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  34.74 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  35.97 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  29.74 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  34.6 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  35.18 
 
 		 408 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  33.42 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  32.43 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.91 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  35.55 
 
 		 427 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  32.68 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  33.17 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  31.94 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  33.33 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  34.05 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  33.03 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  34.2 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.63 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  32.19 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  34.38 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  33.01 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  35.63 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  33.66 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  33.66 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  33.66 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  33.66 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  34.29 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  33.66 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  33.66 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>