248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0642 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  88.86 
 
 		 432 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  100 
 
 		 432 aa  857    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  54.3 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  52.03 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  51.43 
 
 		 408 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.23 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  49.18 
 
 		 418 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  45.82 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  46.79 
 
 		 409 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  46.12 
 
 		 585 aa  361  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  44.92 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  43.44 
 
 		 402 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.66 
 
 		 412 aa  345  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  43.03 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  44.8 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  46.23 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  43.99 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  43.06 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  46.96 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  45.54 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.65 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  45.96 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  44.83 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  45.28 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  45.28 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  45.28 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  45.05 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  44.81 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  45.18 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  44.86 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  45.18 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  45.37 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  46.03 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  44.58 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  44.81 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.29 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  45.05 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  45.14 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  45.14 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  44.86 
 
 		 418 aa  329  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  44.34 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  41.53 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  44.71 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  41.97 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  43.71 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  44.71 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  44.71 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  40.14 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  41.49 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  44.71 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  41.97 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  44.47 
 
 		 419 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.44 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  40.48 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  40.71 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  39.81 
 
 		 402 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  44.07 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  40.71 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  45.22 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  42.14 
 
 		 416 aa  312  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.14 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  39.95 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  41.72 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  40.42 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  41.72 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  41.18 
 
 		 420 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  42.89 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.85 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  40.79 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  40.48 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  39.47 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  40.93 
 
 		 425 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  40.09 
 
 		 414 aa  299  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  41.6 
 
 		 371 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  39.49 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  39.49 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  41.13 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.07 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  42.07 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  39.49 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.22 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  42.07 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  40.91 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  40.24 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  40.24 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  40.24 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  39.49 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  37.41 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  39.72 
 
 		 566 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  39.26 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  38.28 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  38.28 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  38.28 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  38.28 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  41.71 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  39.08 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>