More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2693 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  57.55 
 
 		 130 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  58.51 
 
 		 121 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  51.33 
 
 		 125 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  56.57 
 
 		 112 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 		 118 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  58.51 
 
 		 116 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  49 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.04 
 
 		 107 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.04 
 
 		 107 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  46.15 
 
 		 141 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  46.28 
 
 		 154 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 111 aa  102  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41.8 
 
 		 118 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 		 144 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.04 
 
 		 107 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  51.04 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  44.35 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  51.04 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  51.04 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  51.04 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 112 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  51.04 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.51 
 
 		 107 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 107 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 109 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.51 
 
 		 107 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 107 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 159 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 125 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.02 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 121 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  56.04 
 
 		 116 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 124 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 119 aa  99  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.84 
 
 		 129 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  50.49 
 
 		 125 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 126 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 115 aa  98.6  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 134 aa  98.6  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 117 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 119 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 134 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 108 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 151 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 120 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 124 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 124 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 112 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 140 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 112 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 115 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 		 119 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 118 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 115 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 131 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 119 aa  95.1  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 110 aa  95.1  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 133 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 126 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 140 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 116 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 105 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 113 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 124 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 106 aa  93.6  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 		 119 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 127 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 130 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 119 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 160 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 107 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  47.47 
 
 		 122 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.35 
 
 		 140 aa  91.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 110 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  44.79 
 
 		 114 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 116 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 106 aa  90.5  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  36.45 
 
 		 129 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 108 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 112 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.67 
 
 		 114 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>