275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2362 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  92.07 
 
 		 291 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  80.76 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  82.76 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  54.91 
 
 		 292 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  54.55 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  46.42 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  43.94 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  46.26 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  47.1 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.56 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  48.94 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  44.48 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  51.14 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  46.62 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  40.07 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.71 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  39.86 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  43.05 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  39.86 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  41.43 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  43.88 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  40.58 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 		 299 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  39.51 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  39.46 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  40.36 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.29 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  42.7 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  44.44 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  39.29 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  33.93 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  42.61 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  39.74 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.43 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  39.43 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  36 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.62 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  34.51 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  36.14 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  34.15 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  37.88 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  34.63 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  35.69 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  34.28 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  33.92 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  30.66 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  34.39 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  32.53 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  32.37 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  32.42 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  30.39 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  33.89 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  34.64 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  30.95 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  32.98 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  32.53 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  31.79 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.01 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  29.96 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  30.61 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  32.52 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  32.52 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  32.77 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  30.74 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  32.77 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  32.77 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.8 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  33.22 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  32.61 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  34.58 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.62 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  29.03 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  31.52 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.09 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  31.65 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  29.62 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  29.73 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  29.73 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>