244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0768 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 588 aa  1117    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  72.67 
 
 		 588 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  62.76 
 
 		 587 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  64.8 
 
 		 585 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  31.34 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  34.03 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  31.92 
 
 		 622 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.64 
 
 		 623 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  29.1 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  36.87 
 
 		 623 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.51 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  34.98 
 
 		 452 aa  157  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  34.13 
 
 		 623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 		 704 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  33.85 
 
 		 487 aa  143  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  25.45 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  28.39 
 
 		 618 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  33.68 
 
 		 503 aa  128  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  33.84 
 
 		 632 aa  126  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.72 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  33.44 
 
 		 632 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 		 632 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.41 
 
 		 623 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  31.07 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  31.72 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.5 
 
 		 623 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  30.69 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  21.42 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  21.5 
 
 		 637 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 		 472 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 		 818 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  32.63 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 		 487 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 698 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  31.31 
 
 		 627 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 		 478 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.54 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  22.93 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  27.51 
 
 		 477 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.66 
 
 		 920 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 		 623 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 		 495 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.13 
 
 		 642 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 		 697 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  24.56 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 482 aa  92  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  25.76 
 
 		 647 aa  91.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  24.71 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.59 
 
 		 653 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  24.71 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  21.62 
 
 		 623 aa  89.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.3 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.16 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 642 aa  89  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  29.97 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  26.7 
 
 		 644 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.51 
 
 		 547 aa  87.4  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  28.03 
 
 		 481 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  25.71 
 
 		 548 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  23.49 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  23.36 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 858 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.3 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 858 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.35 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.2 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  25.64 
 
 		 715 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.34 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  22.74 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>