179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4717 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  236  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  69.42 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  45.13 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  42.98 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  39.5 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  41.12 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  39.66 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  39.13 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  43.9 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  41.32 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  39.25 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.7 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  39.81 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  41.44 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.58 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  37.7 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  39.32 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.68 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  36.89 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.79 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  34.96 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  40.16 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  37.4 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  38.18 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  36.54 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  36.54 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  36.54 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.65 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  38.14 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  36.04 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.7 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.96 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  34.75 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  34.68 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  34.38 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.45 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  35.42 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.38 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.88 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  33.05 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  43.36 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  39.53 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  35.65 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.7 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  39.56 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  36.61 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.45 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.97 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  34.51 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  36.7 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  37.78 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  31.67 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  32.5 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  36.17 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.19 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  39.67 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  34.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>