More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1180 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.37 
 
 
209 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  84.88 
 
 
209 aa  353  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.39 
 
 
209 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.86 
 
 
208 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  75.24 
 
 
227 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  71.08 
 
 
214 aa  284  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.1 
 
 
214 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  70.1 
 
 
214 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.1 
 
 
214 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.27 
 
 
221 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.16 
 
 
214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 
214 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  66.18 
 
 
205 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  66.18 
 
 
203 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  64.71 
 
 
203 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 
227 aa  267  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  66.02 
 
 
203 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.93 
 
 
208 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  64.39 
 
 
225 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  64.22 
 
 
208 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  61.95 
 
 
208 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  65.85 
 
 
206 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.73 
 
 
205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  60 
 
 
219 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  62.75 
 
 
300 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  62.25 
 
 
266 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  63.73 
 
 
203 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  62.25 
 
 
214 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  62.25 
 
 
214 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  63.24 
 
 
217 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  62.25 
 
 
297 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  62.25 
 
 
214 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  60.78 
 
 
203 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.75 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.29 
 
 
205 aa  242  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.49 
 
 
205 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 
203 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  57.56 
 
 
213 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  58.33 
 
 
223 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  61.81 
 
 
207 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  58.38 
 
 
220 aa  225  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  51.78 
 
 
214 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  56.86 
 
 
203 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  53.92 
 
 
206 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.57 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.47 
 
 
205 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.98 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  47.72 
 
 
199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  43.81 
 
 
200 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  47.21 
 
 
207 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  43.65 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  42.93 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  43.15 
 
 
198 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  40.82 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 
215 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  40.69 
 
 
212 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
216 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  39.22 
 
 
200 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  35.78 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  38.89 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 
200 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  33.66 
 
 
210 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  35.78 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 
202 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 
204 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 
198 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  34.83 
 
 
198 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 
200 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  36.63 
 
 
200 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  35.75 
 
 
216 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  37.44 
 
 
220 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  39.9 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  36.95 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  34.48 
 
 
216 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  38.5 
 
 
201 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  34.16 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  34.98 
 
 
228 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  35.44 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  37.5 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  33 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  35.44 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  33.82 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
213 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  33.5 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  33.82 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  33.67 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  30.58 
 
 
203 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.34 
 
 
203 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  30.54 
 
 
199 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.69 
 
 
195 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.52 
 
 
213 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  35.94 
 
 
207 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  35.75 
 
 
195 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>