More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0195 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  93.49 
 
 		 496 aa  919    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  79.07 
 
 		 473 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  94.12 
 
 		 496 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  79.07 
 
 		 473 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  81.61 
 
 		 473 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  974    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  71.55 
 
 		 473 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  73.25 
 
 		 482 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  77.43 
 
 		 474 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 496 aa  922    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  76.79 
 
 		 474 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.41 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  60.77 
 
 		 478 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.48 
 
 		 476 aa  578  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  55.82 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.47 
 
 		 470 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.75 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 470 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  54.68 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  54.47 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  54.05 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  42.13 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  40.17 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 532 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 473 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 475 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 480 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 472 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 475 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  40.77 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 530 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 480 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.04 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 482 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.71 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 474 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 474 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 474 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 475 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 474 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 477 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 473 aa  339  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  39.83 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.89 
 
 		 475 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4286  transcriptional regulator  42.04 
 
 		 497 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 491 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.15 
 
 		 487 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 473 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.62 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 470 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.01 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.79 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>