216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3032 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  79.6 
 
 		 365 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  79.6 
 
 		 365 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  54.6 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  38.68 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  27.7 
 
 		 667 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  28.75 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.62 
 
 		 618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  25.76 
 
 		 618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  24.92 
 
 		 618 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  25.76 
 
 		 617 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  24.92 
 
 		 627 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  24.92 
 
 		 627 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.23 
 
 		 618 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  24.62 
 
 		 618 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  24.92 
 
 		 618 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  24.61 
 
 		 618 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.71 
 
 		 580 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  25.42 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  24.75 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.28 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.28 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  26.33 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  25.57 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.49 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.49 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  25.75 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  26.87 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  24.6 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  27.2 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  24.63 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  26.26 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  26.64 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  24.29 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  25.87 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  26.67 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  24.89 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25.79 
 
 		 1506 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  26.67 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.78 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.53 
 
 		 508 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  22.18 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25.79 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  24.74 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 308 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  25.61 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  25.79 
 
 		 328 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  27.5 
 
 		 664 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.81 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.81 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  28.21 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  25.77 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  24.17 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  23.28 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  25.78 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  25.89 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  26.05 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.91 
 
 		 770 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.81 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.07 
 
 		 671 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.5 
 
 		 1449 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.49 
 
 		 322 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  30.25 
 
 		 4098 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  30.25 
 
 		 4101 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0351849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  30.25 
 
 		 4580 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  26.7 
 
 		 665 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  26.88 
 
 		 1436 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  23.26 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  20.89 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>