More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2578 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  323  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  39.22 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 193 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 295 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  38.41 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  37.06 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.59 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  36.09 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  37.69 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.65 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.43 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>