More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3548 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3548  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 109 aa  214  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00527639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0971  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  77.14 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2540  class I peptide chain release factor  75.24 
 
 		 108 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2037  Class I peptide chain release factor  71.43 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00166929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2179  Class I peptide chain release factor  71.43 
 
 		 105 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3508  Class I peptide chain release factor  66.67 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1621  class I peptide chain release factor  66.02 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000216647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  50.59 
 
 		 369 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 357 aa  88.6  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0775  peptide chain release factor 1  58.33 
 
 		 373 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2532  putative peptide chain release factor  48.91 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  64.06 
 
 		 358 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  59.7 
 
 		 367 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  64.06 
 
 		 358 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  64.06 
 
 		 358 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 358 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4206  peptide chain release factor 1  54.17 
 
 		 362 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 360 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 360 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 360 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 375 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 360 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 376 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 359 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  59.72 
 
 		 378 aa  84.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  56.76 
 
 		 376 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 369 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  59.42 
 
 		 369 aa  84  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 		 342 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  57.97 
 
 		 368 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.88 
 
 		 360 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  51.69 
 
 		 321 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.88 
 
 		 360 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.58 
 
 		 330 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  59.42 
 
 		 312 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.5 
 
 		 372 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 363 aa  84  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  55.07 
 
 		 366 aa  83.6  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 		 366 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 		 374 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  58.21 
 
 		 326 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  51.72 
 
 		 375 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 360 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0850  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 373 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41470  peptide chain release factor 1  51.35 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  60.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  59.68 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  60.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  50.65 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  57.33 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  59.68 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  55.88 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  45.68 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  60.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  62.9 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  57.97 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  59.42 
 
 		 375 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.44 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  57.35 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  60.29 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  58.82 
 
 		 406 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  45.16 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  56.76 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 365 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  52.78 
 
 		 372 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  57.35 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  57.35 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  50.54 
 
 		 355 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 354 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  60.29 
 
 		 459 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  46.81 
 
 		 355 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  53.03 
 
 		 364 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  57.97 
 
 		 383 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 360 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  57.97 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  58.21 
 
 		 380 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  62.32 
 
 		 359 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 365 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 360 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  56.58 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  59.42 
 
 		 334 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>