More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3486 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  58.95 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  55.4 
 
 		 285 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  49.43 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  48.87 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  47.35 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  50.78 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  45.62 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  46.18 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  43.35 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  46.51 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  44.36 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  42.12 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  39.05 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.95 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  40.8 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.53 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  37.89 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  41.74 
 
 		 222 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  38.04 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  39.69 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  38.1 
 
 		 374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  35.92 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.12 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  33.8 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  43.84 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.95 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.92 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.57 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  41.24 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.34 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  40.35 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.96 
 
 		 381 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  32.17 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.8 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.53 
 
 		 375 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  42.62 
 
 		 353 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.19 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  40.82 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  32.03 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.15 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  40.14 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  39.58 
 
 		 396 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  33.1 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 369 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  40.14 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  36.15 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.81 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 365 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  36.44 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.09 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.74 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.19 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  46.88 
 
 		 370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1337  HhH-GPD family protein  36.24 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  30.53 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  32.5 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.3 
 
 		 368 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.3 
 
 		 368 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  37.36 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.3 
 
 		 368 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  39.01 
 
 		 352 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.56 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  46.88 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.88 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  46.38 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  43.62 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  32 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  43.36 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.31 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.17 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  42.66 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>