46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2946 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  67.94 
 
 		 131 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  62.2 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  60.8 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  35.77 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.52 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  34.23 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  34.81 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  32.31 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  31.54 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  34.35 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30.83 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  32.99 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  32.31 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  33.87 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.11 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.65 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  42.39 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  42.47 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 		 148 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.48 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  41.33 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  23.68 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.49 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  34.34 
 
 		 133 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 162 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  40.91 
 
 		 260 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  39.73 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  32.26 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  37.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.9 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  52.27 
 
 		 257 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>