282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2531 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 636 aa  1310    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.97 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.21 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  41.19 
 
 		 658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0874  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.87 
 
 		 704 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0878  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.87 
 
 		 704 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0827  superfamily I DNA/RNA helicase  27.38 
 
 		 737 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  29.26 
 
 		 852 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  31.86 
 
 		 689 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 722 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  28.7 
 
 		 755 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  30.67 
 
 		 691 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  31.11 
 
 		 689 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  31.11 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  31.11 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  31.11 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  31.11 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  29.3 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  30.67 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  30.67 
 
 		 691 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  30.22 
 
 		 691 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.55 
 
 		 703 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  25.62 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.02 
 
 		 819 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  28.89 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  25.19 
 
 		 703 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  31.17 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.13 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  25.11 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  25.11 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.57 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.03 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.03 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  30.08 
 
 		 695 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  28.86 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  28.72 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.41 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.28 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  25.76 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  27.56 
 
 		 760 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  30.74 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  29.35 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  30.33 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  30.1 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  25.78 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.05 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  24.23 
 
 		 768 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  30.34 
 
 		 680 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  26.5 
 
 		 829 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  25.14 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.31 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.24 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.16 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  27.57 
 
 		 705 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  25.91 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.9 
 
 		 813 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 780 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.02 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  27.27 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  30.51 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  25.83 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  29.28 
 
 		 742 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  26.01 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 738 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.24 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  25.78 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.18 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  27.65 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  25.43 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.72 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  29.8 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.14 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.67 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.64 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  24.26 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  29.06 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.23 
 
 		 758 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.95 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 706 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  28.32 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.44 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.54 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.67 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 600 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  24.43 
 
 		 778 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.43 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  26.94 
 
 		 723 aa  55.5  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  26.02 
 
 		 902 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.88 
 
 		 785 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  33.09 
 
 		 874 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  23.92 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>