65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2469 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  714    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  64.71 
 
 
344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  64.55 
 
 
344 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  59.88 
 
 
344 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  54.49 
 
 
342 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  51.94 
 
 
348 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  52.12 
 
 
348 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  42.15 
 
 
471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  39.65 
 
 
368 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  38.3 
 
 
354 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  36.55 
 
 
361 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.8 
 
 
356 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  37.08 
 
 
350 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  34.65 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  39.64 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  35.65 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  35.45 
 
 
344 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  32.12 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  35.14 
 
 
346 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.72 
 
 
353 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  31.52 
 
 
349 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  35.86 
 
 
355 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  31.83 
 
 
349 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  32.63 
 
 
351 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  32.94 
 
 
345 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.96 
 
 
346 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  27.63 
 
 
370 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  24.78 
 
 
380 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  27.36 
 
 
369 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  26.44 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  26.15 
 
 
346 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  31.51 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  28.05 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.91 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.09 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.03 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  22.9 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.84 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  22.11 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  20.75 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  24.55 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  21.29 
 
 
353 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  22.15 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  26.19 
 
 
394 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  21.3 
 
 
352 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.88 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  22.22 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.48 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  20.7 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  28.48 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.11 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  22.04 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  23.16 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  24.05 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  24.43 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  23.29 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  21.91 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.7 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.82 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  20.7 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  26.16 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
363 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>