157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0866 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  61.11 
 
 
300 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
221 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
221 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  37.77 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  36.36 
 
 
361 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  48.33 
 
 
148 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
158 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  36 
 
 
186 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.01 
 
 
159 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.6 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
155 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.04 
 
 
158 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
158 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  40 
 
 
158 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  28.57 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5022  hypothetical protein  35.64 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  50 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
157 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
157 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 
349 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  40 
 
 
160 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  39.22 
 
 
530 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 
355 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
226 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
183 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.36 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  37.97 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  41.18 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  46 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
132 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
156 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  44 
 
 
155 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  51.22 
 
 
149 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  29.73 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
143 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
169 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  30.61 
 
 
140 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  30.61 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 
141 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  28.03 
 
 
163 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  30.61 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
154 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
149 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  33 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
185 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
153 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
229 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
137 aa  45.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  27.74 
 
 
152 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.74 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  26.98 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  29.59 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  30.11 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  30.11 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  30.11 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  25.86 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  44.19 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
143 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
147 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>