More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2765 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2765  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  239  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.557597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1786  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 120 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2012  response regulator receiver domain-containing protein  72.57 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1291  response regulator  44.07 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0776  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000835167  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1018  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3346  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.07 
 
 		 417 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1736 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 406 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.04 
 
 		 1180 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  33.88 
 
 		 417 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2852  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 268 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 487 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 453 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1684  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 400 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 500 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  35.77 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3131  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.164774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  33.33 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.1 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  34.96 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  33.91 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.96 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2234  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  32.2 
 
 		 1020 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03265  hypothetical protein  34.78 
 
 		 403 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3940  putative two-component response regulatory protein, response regulator receiver  33.33 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  34.45 
 
 		 414 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 714 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  34.23 
 
 		 575 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  33.9 
 
 		 573 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1137 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1125 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 370 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.46 
 
 		 473 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.46 
 
 		 473 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  34.17 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.94 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  33.88 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 838 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  34.17 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0621  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  38.33 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1055 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 473 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  31.03 
 
 		 903 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 630 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  38.05 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 915 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>