More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2612 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 363 aa  741    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  67.61 
 
 		 355 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  67.42 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  62.61 
 
 		 354 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  63.19 
 
 		 369 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  57.91 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  61.58 
 
 		 354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  44.51 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  43.1 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  45.32 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  41.85 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  44.95 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  42.29 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  40.06 
 
 		 352 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  41.09 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  40.65 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  41.74 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  39.6 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  38.03 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 331 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  34.19 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.57 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.23 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.47 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.51 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  35.24 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.6 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.39 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.03 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  32.96 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.5 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  33.81 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  31.39 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 		 346 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.28 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.85 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.83 
 
 		 321 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  32.32 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.27 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.17 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.75 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.75 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  31.42 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  32.5 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.75 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.68 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.66 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.81 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.19 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  33.99 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  33.62 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  32.09 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.77 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  33.01 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.7 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.61 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  32.7 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.75 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.6 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  29.43 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  35 
 
 		 273 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  29.04 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.63 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  29.97 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  33.66 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.42 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.42 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  30.99 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>