More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1488 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  74.72 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  72.36 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  61.89 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  60.29 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  55.56 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  65.26 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  42.61 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  40.68 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  38.98 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  41.35 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  39.15 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 299 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  38.41 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  37.41 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  38.22 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  39.33 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 360 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  33.22 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  33.92 
 
 		 330 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 		 396 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.31 
 
 		 373 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  38.33 
 
 		 333 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.69 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  30.87 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  36.91 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  32.88 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  35.75 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  32.39 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  41.21 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  31.65 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  32.09 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.07 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  34.2 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  32.96 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.42 
 
 		 388 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  35.26 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  34.03 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  33.45 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  32.28 
 
 		 355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.19 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 		 386 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  39.29 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.81 
 
 		 355 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  33.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  34.45 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  35.83 
 
 		 407 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  36.45 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  33.86 
 
 		 349 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 383 aa  125  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  36 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  37.43 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  38.07 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  32.99 
 
 		 386 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  35.94 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  30.99 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.82 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  31.91 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  31.18 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 382 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  35.14 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  31.19 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  32.38 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  32.65 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  31.94 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  36.32 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  36.6 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.02 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 365 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.55 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  32.16 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  37.13 
 
 		 383 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>