More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2053 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  680    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  58.33 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  59.93 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  54.43 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  39.87 
 
 		 370 aa  241  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  37.99 
 
 		 362 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  38.44 
 
 		 357 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  37.82 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  37.82 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  37.46 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  37.7 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  37.7 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  36.88 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  37.18 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  36.98 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  37.62 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  37.82 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  37.82 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  36.06 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  37.5 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  39.1 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  36.21 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  36.69 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  36.21 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  36.39 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  37.81 
 
 		 366 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  34.97 
 
 		 350 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  39.23 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  37.18 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  34.41 
 
 		 361 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  33.12 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  32.19 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  33.55 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  33.84 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  34.8 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  34.8 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  33.23 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  37.1 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  34.84 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  30.47 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.68 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  32.55 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  32.98 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  32.19 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.22 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  32.58 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  32.58 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  30.97 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  32.58 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  29.18 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  31.55 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  28.4 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  29.97 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.56 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.31 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.31 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  28.16 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.1 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.97 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.07 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  28.9 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  28.04 
 
 		 517 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  26.26 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  26.6 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  26.6 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  26.6 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  26.6 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  26.6 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  26.6 
 
 		 449 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  25.93 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  26.26 
 
 		 488 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  29.05 
 
 		 504 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  26.94 
 
 		 488 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  28.28 
 
 		 506 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.95 
 
 		 511 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  28.28 
 
 		 506 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  25.59 
 
 		 488 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  29.05 
 
 		 527 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.95 
 
 		 511 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.51 
 
 		 493 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.95 
 
 		 511 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.95 
 
 		 511 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  27.12 
 
 		 512 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  26.35 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  28.19 
 
 		 567 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  28.28 
 
 		 503 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  26.62 
 
 		 504 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  26.3 
 
 		 505 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  26.94 
 
 		 478 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  26.26 
 
 		 479 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  26.75 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  27.09 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  26.01 
 
 		 500 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  28.76 
 
 		 483 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  27.95 
 
 		 486 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  24.18 
 
 		 546 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  27.39 
 
 		 661 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  27.67 
 
 		 483 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  27.09 
 
 		 511 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>