156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1361 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  80.68 
 
 		 207 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  51.25 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  51.07 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  48.76 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  47.93 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.57 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  47.72 
 
 		 244 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  47.93 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  48.35 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 		 244 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  46.69 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  44.54 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  40.32 
 
 		 237 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  37.56 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  29.31 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.11 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  24.81 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.53 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  20.98 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.53 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.61 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  25.16 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  24.52 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1212  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000663729  normal  0.0536092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  20 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  20 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  31.45 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  25 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.09 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  22.73 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  22.59 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  25 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  33.33 
 
 		 1215 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2403  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.97 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  23.87 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  22.73 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.17 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.7 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.17 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  25.77 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>