44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1086 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  100 
 
 		 411 aa  846    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  51.74 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  49.23 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  49.6 
 
 		 409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  45.64 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  47.47 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  39.95 
 
 		 410 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  39.21 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  39.5 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  39.4 
 
 		 418 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  39.4 
 
 		 418 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  39.4 
 
 		 418 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  44.1 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  41.64 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  38.97 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  39.23 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  39.29 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  38.81 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  42.68 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  39.63 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  42.41 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  39.63 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  36.6 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  38.56 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  38.46 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  40.56 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  40.25 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  42.52 
 
 		 454 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  40.13 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  33.76 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  34.21 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  35.23 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  32.63 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  27.02 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  30.05 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  25.76 
 
 		 312 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  26.64 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  25.29 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  28.02 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  26.6 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  25.29 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  26.67 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  29.7 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  24.89 
 
 		 252 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>