284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3926 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3926  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 530 aa  1091    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201951  hitchhiker  0.000100344 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3653  DNA-directed DNA polymerase  37.86 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703924 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  22.67 
 
 		 923 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  22.67 
 
 		 923 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  27.75 
 
 		 906 aa  80.5  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  27.41 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  29.26 
 
 		 940 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  25.79 
 
 		 933 aa  77  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  27.51 
 
 		 924 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  29.47 
 
 		 908 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  26.27 
 
 		 879 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 934 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  26.07 
 
 		 932 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  26.22 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  26.07 
 
 		 932 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  26.07 
 
 		 932 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 879 aa  74.3  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  26.61 
 
 		 879 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 923 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 923 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  27.32 
 
 		 943 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  26.61 
 
 		 879 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  28.14 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  25.78 
 
 		 923 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  27.13 
 
 		 921 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  28.51 
 
 		 903 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3087  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 686 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  26.87 
 
 		 929 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  27.54 
 
 		 946 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 896 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  27.59 
 
 		 911 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  28.45 
 
 		 928 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 896 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  27.18 
 
 		 930 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  27.07 
 
 		 936 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  26.43 
 
 		 929 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  25.55 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  28.02 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  25.33 
 
 		 936 aa  71.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  27.18 
 
 		 928 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  25 
 
 		 941 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  27.52 
 
 		 879 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  27.2 
 
 		 912 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  27.04 
 
 		 913 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  26.18 
 
 		 861 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  26.75 
 
 		 906 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  26.32 
 
 		 942 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  26.83 
 
 		 939 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  26.22 
 
 		 913 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  24.51 
 
 		 951 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  28.95 
 
 		 903 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  23.79 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  27.43 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  22.56 
 
 		 903 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  29.66 
 
 		 937 aa  68.2  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  27.51 
 
 		 913 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  23.79 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  23.79 
 
 		 917 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  28.29 
 
 		 903 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  24.93 
 
 		 910 aa  67.8  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  25.33 
 
 		 947 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  27.04 
 
 		 921 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  23.79 
 
 		 917 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  28.51 
 
 		 861 aa  67  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  27.19 
 
 		 908 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  27.95 
 
 		 903 aa  67  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  25.54 
 
 		 875 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  25.33 
 
 		 915 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  24 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  26.18 
 
 		 908 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 926 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  26.72 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  26.36 
 
 		 875 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  27.05 
 
 		 931 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  24.56 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  24.89 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  27.09 
 
 		 923 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  29.05 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  24.87 
 
 		 880 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  26.47 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  27.16 
 
 		 965 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  24.89 
 
 		 930 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  23.21 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  25.33 
 
 		 927 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  23.21 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  25.37 
 
 		 922 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  27.31 
 
 		 908 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  27.59 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  25.32 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  24.44 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  26.01 
 
 		 885 aa  64.3  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  24.02 
 
 		 944 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  27.04 
 
 		 931 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  28.07 
 
 		 899 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2445  DNA polymerase I  24.45 
 
 		 1015 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  27.23 
 
 		 905 aa  63.9  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>